-100万規模の1細胞発現データで検証- 理化学研究所(理研)生命機能科学研究センターバイオインフォマティクス研究開発チームの露崎弘毅特別研究員、二階堂愛チームリーダーらの共同研究チームは、大規模1細胞発現データを高精度・高速・低メモリで ...
ショートリードRNA塩基配列解読データから転写物をアセンブリーする方法の正確性は、長距離情報の欠如によって限定されている。本論文では、転写物を長さで分別してから塩基配列解読を行い、追加情報を用いて転写物の定量化とアセンブリーを改善する ...
シングルセルRNA-seqデータからもとの細胞種を同定する、深層学習を用いた新しい手法scDeepInsightを提案しました。 1細胞ごとの発現データを前処理後に画像化することにより、深層学習が持つ画像分類や特徴抽出の利点を最大限に活用できます。それに ...
理化学研究所(理研)は、次世代シーケンサ(超高速塩基配列解読装置)で得られた断片化RNAの情報から、細胞内に本来存在している全長RNAの情報を高精度に再構築する解析プログラム「ARTADE2(アートエイド ツー)」を開発したことを発表した。同成果は、理研 ...
1細胞RNA-seq(※1)データを用いて、X染色体不活化(※2)からの逃避を定量するソフトウェアsinglecell Level inactivated X chromosome ...
差次的遺伝子発現の全ゲノム解析に関するRNA塩基配列解読(RNA-seq)とマイクロアレイの一致率は、さまざまな化学的処理条件による厳密な評価が行われていない。今回、網羅的試験デザインにより、イルミナ社のRNA-seqとアフィメトリクス社のマイクロ ...
WILMINGTON, DE / ACCESS Newswire / August 12, 2025 / InnoSIGN, a leader in diagnostic-ready computational biology, today announced the launch of the InnoSIGN Portal, a powerful, first-in-class ...
New platform empowers researchers and drug developers with secure, on-demand functional pathway analysis from RNA-seq data WILMINGTON, DE / ACCESS Newswire / August 12, 2025 / InnoSIGN, a leader in ...