ショートリードRNA塩基配列解読データから転写物をアセンブリーする方法の正確性は、長距離情報の欠如によって限定されている。本論文では、転写物を長さで分別してから塩基配列解読を行い、追加情報を用いて転写物の定量化とアセンブリーを改善する ...

－100万規模の1細胞発現データで検証－ 理化学研究所（理研）生命機能科学研究センターバイオインフォマティクス研究開発チームの露崎弘毅特別研究員、二階堂愛チームリーダーらの共同研究チームは、大規模1細胞発現データを高精度・高速・低メモリで ...

1細胞RNA-seq（※1）データを用いて、X染色体不活化（※2）からの逃避を定量するソフトウェアsinglecell Level inactivated X chromosome ...

理化学研究所(理研)は、次世代シーケンサ(超高速塩基配列解読装置)で得られた断片化RNAの情報から、細胞内に本来存在している全長RNAの情報を高精度に再構築する解析プログラム「ARTADE2(アートエイド ツー)」を開発したことを発表した。同成果は、理研 ...

最近のENCODEプロジェクトの結果によれば、ヒトゲノムの70％以上が転写されるが、全てが同じタイプの細胞で起こることは絶対にないといい、自然界には長鎖RNA、低分子RNA、マイクロRNA、さらには環状RNAまで、さまざまなRNAが見いだされている。このように ...

理化学研究所（理研） 生命医科学研究センター 医科学数理研究チームの角田 達彦チームリーダー（東京大学 大学院理学系研究科 生物科学専攻 医科学数理研究室 教授、東京医科歯科大学 難治疾患研究所 医科学数理分野 教授）らの国際共同研究グループは ...

次のとおり公開見積競争に付します。 (4)履行場所 国立研究開発法人産業技術総合研究所 北海道センター 2．公開見積競争に参加する者に必要な資格 (1)次のイ及びロに掲げる場合のいずれにも該当する者ではないこと。 イ 国立研究開発法人産業技術総合 ...

STAP細胞のデータ解析をしていた理化学研究所統合生命医科学研究センター・統合ゲノミクス研究グループの遠藤高帆氏が10月1日、記者会見を開き、分析結果を報道関係者向けに発表した。 理研の小保方晴子ユニットリーダーらが英科学誌「Nature」に投稿し ...

次のとおり公開見積競争に付します。 2．公開見積競争に参加する者に必要な資格 (1)次のイ及びロに掲げる場合のいずれにも該当する者ではないこと。 イ 国立研究開発法人産業技術総合研究所の役員経験者が再就職している又は課長相当級以上の職の経験 ...